Функциональная диагностика имеет свои, отличные от инструментальной и лабораторной диагностики, задачи. Функциональные исследования предоставляют сведения о компенсированности или недостаточности той или иной функции, т. е. о сохранности либо потере функциональной способности органа. При этом функции организма могут исследоваться как в покое, так в условиях специальных физических или медикаментозных нагрузок.